生命科学领域集群存储实践
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方案概述
随着高通量测序实验和生物信息学在人类健康领域的应用,数据呈现快速增长。其业务场景的独特多任务分析流程努力自动实现大量迭代操作和重复读写数据,这给存储系统带来了新的挑战。对大规模生物数据的有效访问将提高匹配业务的效率。
应用背景
从细胞的发现到生物工程和基因工程的开发和应用,生命科学的研究已经变得更加系统化、规模化和数字化。其中一个突出的表现就是完成了大量的生物基因组测序,这催生了生物信息学的快速发展。
随着高通量测序实验技术和生物信息学在生命科学研究和人类健康中的应用,生物信息被转化为数字信息。这些数据来自大量的生物样本、科学研究的中间数据和实验结果。数据类型主要是文件,并进行许多科学计算。这种数字信息,就像黄金开采一样,正等待被挖掘出价值。因此,海量生物数据的存储、读取和挖掘面临着机遇和挑战。
系统功能
集群存储支持按需多维扩展和构建
节点的容量和io负载平衡,聚合带宽,适合高吞吐量并发访问要求
统一虚拟存储池,显示不同计算环境或应用程序的相同空视图
码头工人部署、应用和分析工具以及存储共生
支持计算任务卸载到集群存储,具有很强的开放性
集群独立高速内部通道,快速数据分发和均衡分发
兼容主流硬盘、操作系统和访问协议,通用性好
程序功能
荣智联(002642,诊断单元)xtore分布式集群存储系统帮助客户解决数据空和数据持久性问题。提供灵活并发的pb级统一存储资源池,满足计算集群中数十到数百个节点的并发读写和数据共享需求。它的可扩展性使得在非结构化数据快速增长的情况下很容易实现逐步扩展。Xtore集成了生产、科研和仪器的存储需求,实现了分析过程各个环节的数据流,支持过程自动化的实现。
Xtore系统支持集装箱化部署,可以将一些客户的计算转移到存储系统,优化数据流,降低网络负载,提高生产效率。
顾客价值
根据业务需求动态扩大存储规模,减少一次性设备采购投资;
聚合带宽和并发访问,以满足数十到数百个计算集群的同时访问;
有效性,上传实验数据后,可以进入多任务分析过程,缩短计算周期,提高时效性和生产研究效率;
基于以太网高速互联,支持标准接入协议,与计算平台完全兼容;
存储系统是容器化的,与应用程序共存,并合理匹配和利用计算存储资源。
内置数据特征引擎通过与数据管理接口,可以进一步提高复杂数据的处理能力。
典型案件
北京金加科技有限公司(gene+)专注于基因技术,从事医疗卫生领域的科研、应用开发和产业服务,是一家集科研、临床试验和卫生服务为一体的基因技术公司。
公司专注于肿瘤基因检测领域,该领域是根据国际临床基因检测实验室标准建立的。目前,已经形成了基于高通量基因测序技术和生物信息学分析的ctdna精确检测系统,实现了肿瘤的无创、准确、动态的基因分析,并提供了精确用药、疗效监测、术后复发监测、风险预测和早期检测等临床服务。
Xtore分布式集群存储系统用于解决业务系统的原始数据、过程数据和结果数据的存储和读取问题。
应用容器和存储系统的融合允许生物分析计算将非计算密集型任务卸载给存储控制器。
存储系统和生物计算调度的紧密集成使得存储系统能够了解应用特性并调度适当的存储资源。
存储系统同时考虑可靠性、可用性和访问带宽,并持续提供存储服务。
客户名单
[编辑:荔湾]
标题:生命科学领域集群存储实践
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